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| Registros recuperados : 9 | |
| 2. |  | CABEZAS, W. A. R. L.; ARRUDA, M. R. de; CANTARELLA, H.; PAULETTI, V.; TRIVELIN, P. C. O.; BENDASSOLLI, J. A. Imobilização de nitrogênio da uréia e do sulfato de amônio aplicado em pré-semeadura ou cobertura na cultura de milho, no sistema plantio direto. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, v. 29, n. 2, p. 215-226, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 3. | | TRIVELIN, P. C. O.; OLIVEIRA, M. W. de; VITTI, A. C.; GAVA, G. J. de C.; BENDASSOLLI, J. A. Perdas do nitrogênio da uréia no sistema solo-planta em dois ciclos de cana-de-açúcar. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 2, p. 193-201, fev. 2002 Título em inglês: Nitrogen losses of applied urea in the soil-plant system during two sugar cane cycles.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | SILVA, E. C. da; MURAOKA, T.; BASTOS, A. V. S.; FRANZINI, V. I.; BUZETTI, B.; SOARES, F. A. L.; TEIXEIRA, M. B.; BENDASSOLLI, J. A. Biomass and nutrient accumulation by cover crops and upland rice grown in succession under no-tillage system as affected by nitrogen fertilizer rate. Journal of Crop Science and Biotechnology, v.23, n.2, p. 117-126, mar. 2020. 10 p.| Biblioteca(s): Embrapa Cocais. |
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| 5. | | SILVA, E. C. da; MURAOKA, T.; FRANZINI, V. I.; SAKADEVAN, K.; BUZETTI, S.; ARF, O.; BENDASSOLLI, J. A.; SOARES, F. A. L. Use of nitrogen from fertilizer and cover crops by upland rice in an Oxisol under no-tillage in the Cerrado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 6, p. 728-737, jun. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Solos / UEP-Recife; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | PESSENDA, L. C. R.; GOUVEIA, S. E. M.; LEDRU, M. P.; SIFEDDINE, A.; MENOR, E.; BOULET, R.; FILIZOLA, H. F.; RIBEIRO, A. S.; FREITAS, A.; ARAVENA, R.; BENDASSOLLI, J. A.; GUERRA, M. F. Estudos multi/interdisciplinares visando a reconstrução paleoambiental (vegetação e clima) de distintas regiões do nordeste no pleistoceno tardio e holoceno: resultados preliminares. In: CONGRESSO SOBRE PLANEJAMENTO E GESTÃO DAS ZONAS COSTEIRAS DOS PAíSES DE EXPRESSÃO PORTUGUESA, 2., CONGRESSO DA ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DE ESTUDOS DO QUARTENÁRIO, 9.; CONGRESSO DO QUARTENÁRIO DE PAÍSES DE LÍNGUAS IBÉRICAS, 2., Recife/PE, 2003. Anais... Recife: ABEQUA, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 7. | | PESSENDA, L. C. R.; GOUVEIA, S. E. M.; LEDRU, M. P.; ARAVENA, R.; RICARDI-BRANCO, F. S.; BENDASSOLLI, J. A.; RIBEIRO, A. S.; SAIA, S. E. M. G.; SIFEDDINE, A.; MENOR, E. de A.; OLIVEIRA, S. M. B. de; CORDEIRO, R. C.; FREITAS, A. M. de M.; BOULET, R. : FILIZOLA, H. F.; FILIZOLA, H. F. Interdisciplinary paleovegetation study in the Fernando de Noronha Island (Pernambuco State), northeastern Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 80, n. 4, p. 1-15, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 8. | | BIELUCZYK, W.; ASSELTA, F. O.; NAVROSKI, D.; GONTIJO, J. B.; VENTURINI, A. M.; MENDES, L. W.; SIMON, C. P.; CAMARGO, P. B. de; TADINI, A. M.; MARTIN NETO, L.; BENDASSOLLI, J. A.; RODRIGUES, R. R.; van der PUTTEN, H. W.; TSAI, S. M. Linking above and belowground carbon sequestration, soil organic matter properties, and soil health in Brazilian Atlantic Forest restoration. Journal of Environmental Management, v. 344, 118573, 2023. 15 p.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 9. | | GOUVEIA, S. E. M.; PESSENDA, L. C. R.; ARAVENA, R.; LEDRU, M. P.; SIFEDDINE, A.; RICARDI-BRANCO, F.; CORDEIRO, R. C.; MENOR, E. A.; SAIA, S. E. M. G.; OLIVEIRA, S. M. B.; BENDASSOLLI, J. A.; RIBEIRO, A. S.; FREITAS, A. M. M.; BOULET, R.; FILIZOLA, H. F. Vegetation and climate changes in the northeastern region of Brazil during late pleistocene and holocene. In: INTERNATIONAL RADIOCARBON CONFERENCE, 19., 2006, Oxford, Inglaterra. Abstracts & programme. Oxford, Inglaterra: University of Oxford, 2006. p. 263-264.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| Registros recuperados : 9 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
23/07/2021 |
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Data da última atualização: |
23/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LÜHRS, L.; SOUSA, V. A. de; ROSSINI, B. C.; KESTRING, D. R.; AGUIAR, A. V. de. |
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Afiliação: |
LARISSA LÜHRS, Bolsista Embrapa Florestas; VALDERES APARECIDA DE SOUSA, CNPF; BRUNO CÉSAR ROSSINI, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; DAIANE RIGONI, CNPF; ANANDA VIRGINIA DE AGUIAR, CNPF. |
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Título: |
Identificação de microssatélites e síntese de primes para erva-mate a partir de programas de bioinformática. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
In: EVENTOS ARAUCÁRIA: PESQUISA, INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA SISTEMAS DE PRODUÇÃO, ERVA-MATE XXI: INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA O SETOR ERVATEIRO, 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2021. |
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Páginas: |
p. 50. |
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Série: |
(Embrapa Florestas. Documentos, 344). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo. |
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Conteúdo: |
A erva-mate (Ilex paraguariensis S. T. Hill) gera o produto florestal não madeireiro mais importante do agronegócio da região Sul do Brasil. A demanda internacional pela erva-mate vem aumentando, favorecendo o desenvolvimento da sua produção e competitividade. A caracterização genética é indispensável para o estabelecimento de estratégias de conservação e melhoramento genéticos para essa espécie. Atualmente, diferentes ferramentas genômicas estão disponíveis para desenvolvimento de marcadores moleculares, sendo os microssatélites, ou SSRs (sequências simples repetidas) uma das mais utilizadas no estudo genético de populações. Assim, o objetivo desde trabalho foi identificar e desenvolver microssatélites para erva-mate. O DNA de um indivíduo foi utilizado para realizar, a partir da plataforma Illumina-Miseq, um total de 12.933.970 leituras. Para a sua identificação, foram utilizados diferentes programas: PERF, SSR_pipeline e Primer3Plus. Com o auxílio do PERF, foram analisadas as sequências (em arquivo fasta), totalizando 17.715 ocorrências repetidas para variados números de motifs repetidos. O SSR_pipeline utilizou outros arquivos de entrada (fastq) com 12.933.970 leituras e identificou inúmeros SSRs. Assim, associando os resultados dos dois programas, pares de primers flanqueando os microssatélites foram desenhados no Primer3Plus para 18 marcadores. Alguns parâmetros especificados foram: tamanhos, temperaturas e porcentagem de GC (mínimos, ideais e máximos). Seis potenciais marcadores identificados serão validados para a confecção dos iniciadores para esta espécie. Essa ferramenta deverá ser aplicada para análises genéticas diversas, na caracterização genética de populações naturais e sintéticas e em bancos de germoplasma. Novos recursos de bioinformática poderão ser explorados para essa mesma finalidade. MenosA erva-mate (Ilex paraguariensis S. T. Hill) gera o produto florestal não madeireiro mais importante do agronegócio da região Sul do Brasil. A demanda internacional pela erva-mate vem aumentando, favorecendo o desenvolvimento da sua produção e competitividade. A caracterização genética é indispensável para o estabelecimento de estratégias de conservação e melhoramento genéticos para essa espécie. Atualmente, diferentes ferramentas genômicas estão disponíveis para desenvolvimento de marcadores moleculares, sendo os microssatélites, ou SSRs (sequências simples repetidas) uma das mais utilizadas no estudo genético de populações. Assim, o objetivo desde trabalho foi identificar e desenvolver microssatélites para erva-mate. O DNA de um indivíduo foi utilizado para realizar, a partir da plataforma Illumina-Miseq, um total de 12.933.970 leituras. Para a sua identificação, foram utilizados diferentes programas: PERF, SSR_pipeline e Primer3Plus. Com o auxílio do PERF, foram analisadas as sequências (em arquivo fasta), totalizando 17.715 ocorrências repetidas para variados números de motifs repetidos. O SSR_pipeline utilizou outros arquivos de entrada (fastq) com 12.933.970 leituras e identificou inúmeros SSRs. Assim, associando os resultados dos dois programas, pares de primers flanqueando os microssatélites foram desenhados no Primer3Plus para 18 marcadores. Alguns parâmetros especificados foram: tamanhos, temperaturas e porcentagem de GC (mínimos, ideais e máximos). Seis pote... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Erva-mate. |
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Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Ilex Paraguariensis. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224637/1/EmbrapaFlorestas-2021-AnaisErvamateEAraucaria-Documentos344-pg50.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: EVENTOS ARAUCÁRIA: PESQUISA, INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA SISTEMAS DE PRODUÇÃO, ERVA-MATE XXI: INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA O SETOR ERVATEIRO, 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas$c2021
300 $ap. 50.
490 $a(Embrapa Florestas. Documentos, 344).
500 $aResumo.
520 $aA erva-mate (Ilex paraguariensis S. T. Hill) gera o produto florestal não madeireiro mais importante do agronegócio da região Sul do Brasil. A demanda internacional pela erva-mate vem aumentando, favorecendo o desenvolvimento da sua produção e competitividade. A caracterização genética é indispensável para o estabelecimento de estratégias de conservação e melhoramento genéticos para essa espécie. Atualmente, diferentes ferramentas genômicas estão disponíveis para desenvolvimento de marcadores moleculares, sendo os microssatélites, ou SSRs (sequências simples repetidas) uma das mais utilizadas no estudo genético de populações. Assim, o objetivo desde trabalho foi identificar e desenvolver microssatélites para erva-mate. O DNA de um indivíduo foi utilizado para realizar, a partir da plataforma Illumina-Miseq, um total de 12.933.970 leituras. Para a sua identificação, foram utilizados diferentes programas: PERF, SSR_pipeline e Primer3Plus. Com o auxílio do PERF, foram analisadas as sequências (em arquivo fasta), totalizando 17.715 ocorrências repetidas para variados números de motifs repetidos. O SSR_pipeline utilizou outros arquivos de entrada (fastq) com 12.933.970 leituras e identificou inúmeros SSRs. Assim, associando os resultados dos dois programas, pares de primers flanqueando os microssatélites foram desenhados no Primer3Plus para 18 marcadores. Alguns parâmetros especificados foram: tamanhos, temperaturas e porcentagem de GC (mínimos, ideais e máximos). Seis potenciais marcadores identificados serão validados para a confecção dos iniciadores para esta espécie. Essa ferramenta deverá ser aplicada para análises genéticas diversas, na caracterização genética de populações naturais e sintéticas e em bancos de germoplasma. Novos recursos de bioinformática poderão ser explorados para essa mesma finalidade.
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Embrapa Florestas (CNPF) |
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